L'Assemblea dei soci
I volontari che sono iscritti all'Associazione Intercultura si riuniscono una volta all'anno in Assemblea per discutere ed approvare l'attività ed i relativi bilanci e per eleggere un Consiglio d'Amministrazione.

Il Consiglio di Amministrazione
L’Associazione Intercultura è amministrata da un Consiglio di Amministrazione composto da 10 membri, di cui nove eletti dall’Assemblea dei Soci e uno cooptato in rappresentanza dell’Associazione Nazionale dei Dirigenti e delle Alte Professionalità della Scuola. I Consiglieri sono volontari dell’Associazione, che mettono gratuitamente a disposizione la propria lunga esperienza, offrendosi di operare non solo sul piano pratico, ma anche su quello decisionale ed amministrativo.

La Segreteria Generale
Il Consiglio d'Amministrazione nomina un Segretario Generale, che insieme ad un Direttore Esecutivo cura la gestione dell'Associazione sia nelle tre sedi nazionali di Roma, Milano e Colle di Val d'Elsa, che nelle ramificazioni locali in oltre 130 città.

L'Advisory Board
L’Advisory Board è formato da ex-borsisti di Intercultura, che occupano posizioni eminenti nella vita nazionale. I membri sono nominati dal Consiglio d’Amministrazione per cinque anni, con il compito di essere testimoni eccellenti dei valori dell’Associazione e di aiutarla a conseguire i suoi obiettivi.